ไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์เป็นสารฆ่าเชื้อทั่วไป และควรใช้ข้อควรระวังต่อไปนี้เมื่อใช้งาน
1. ข้อควรระวังในการเจือจาง: โดยทั่วไปจะต้องเจือจางไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ก่อนใช้งาน และควรกำหนดอัตราส่วนการเจือจางตามการใช้งานและความเข้มข้นเฉพาะ ไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ที่มีความเข้มข้นสูงอาจทำให้เกิดการระคายเคืองและความเสียหายต่อผิวหนังและดวงตา ดังนั้นจึงควรอ่านคำแนะนำอย่างละเอียดก่อนใช้งานและเจือจางตามคำแนะนำ
2. หลีกเลี่ยงการผสม: การผสมไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์กับสารบางชนิด เช่น น้ำส้มสายชูและแอลกอฮอล์ อาจทำให้เกิดปฏิกิริยาทางเคมีที่เป็นอันตรายได้ ดังนั้นเมื่อใช้ไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์จึงควรหลีกเลี่ยงการผสมกับสารอื่น ๆ เพื่อหลีกเลี่ยงปฏิกิริยาเคมีที่เป็นอันตรายหรือการปล่อยก๊าซพิษ
3. ข้อควรระวังในการเก็บรักษา: ควรเก็บไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ไว้ในที่เย็น แห้ง และอากาศถ่ายเทได้สะดวก และห่างจากแหล่งกำเนิดประกายไฟและสารติดไฟได้ หลีกเลี่ยงแสงแดดโดยตรงและสภาพแวดล้อมที่มีอุณหภูมิสูงเพื่อหลีกเลี่ยงการเผาไหม้ที่เกิดขึ้นเองหรือปฏิกิริยาที่รุนแรง
นอกเหนือจากข้อควรระวังข้างต้นแล้ว ยังจำเป็นต้องสวมถุงมือและหน้ากากเมื่อใช้เพื่อหลีกเลี่ยงการสัมผัสโดยตรงกับผิวหนังและการสูดดมไอไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ ขณะเดียวกันเมื่อใช้ไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์ระวังอย่าให้กระเด็นเข้าตา หากกระเด็นเข้าตาโดยไม่ได้ตั้งใจ ให้ล้างออกด้วยน้ำสะอาดทันทีและไปพบแพทย์ นอกจากนี้ ควรใช้ภาชนะบรรจุไฮโดรเจนเปอร์ออกไซด์หลังการใช้งานอย่างเหมาะสม เพื่อหลีกเลี่ยงไม่ให้เด็กกลืนหรือสัมผัสโดยไม่ได้ตั้งใจ